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上海市疾控中心病原所下设细菌检测实验室、病毒检测实验室、消毒感染控制和卫生微生物检测实验室、免疫规划实验室和菌毒种保藏及管理中心等5个科室，是负责细菌性、病毒性生物因子、疫苗可预防疾病、消毒与感染控制效果等监测检验任务，以及菌毒种保藏和安全运送管理的专业部门，也是一支病原微生物检测“一锤定音”的铁军，承担了本市重大或新发突发传染病相关病原体的实验室检测工作，为城市和人民筑起坚实可靠的健康“防护墙”。

病原所成立以来先后建立了9个国家级网络和参比实验室，包括：国家致病菌识别网上海中心实验室、中国细菌性传染病分子分型监测网络上海区域中心实验室、国家食品安全风险监测副溶血性弧菌参比实验室、国家流感监测省级参比实验室、国家病毒性腹泻监测网络实验室、中国新冠实验室监测网络实验室、国家手足口病监测网络实验室、中国省级乙脑参比实验室、脊灰/麻疹/风疹参比实验室。

一个涵盖全市16家区疾控微生物实验室、各哨点医院的监测网络正日臻完善，历年来已成功应对埃博拉、MERS、SARS等疫情防控。

“1+16”织密检测网

近两年来，病原所持续推进本市微生物网络实验室检测能力和工作内容同质化，带动区疾控实验室检测能力和规模持续增长，形成能力全面、各有特长的“1+16”网络实验室体系。

团队打造了若干区域性公共卫生中心实验室，推动区级疾控部门具备病原体测序溯源等核心能力，全面提升“一锤定音”的检测鉴定能力。

“一码到底”架起信息桥

病原所加强区级网络实验室的标准化、规范化、信息化，推进全市监测工作的实验室信息化标准体系建设，加强全市样本检测“一码到底”管理，强化市区检测信息资源共享、检测控制的等同和结果互认机制。

质控中心打牢奠基石

病原所积极建设区域公共卫生实验室检验检测质控中心，以检测质量控制为抓手，遵循平战结合、资源共享、技术为先的方针，引领全市公共卫生实验室网络的高质量发展。团队在质量控制规范、标准化检测技术平台、生物安全防护体系、规范化数据利用等各方面促进资源整合，并形成常规级、战略级病原学检测能力评价规范。